Menelusuri sejarah Islam di Asia Tenggara tidak akan pernah lepas dari peran besar para pemikir dan pendidik yang mendedikasikan hidupnya untuk menyebarkan ilmu pengetahuan. Upaya mengungkap Jejak Ulama Nusantara kini menjadi prioritas utama bagi lembaga pendidikan yang sadar akan pentingnya identitas sejarah. Salah satunya adalah Dayah Syaikhuna, sebuah institusi yang merasa memiliki tanggung jawab moral untuk menjaga mata rantai keilmuan yang telah diwariskan secara turun-temurun. Tanpa upaya pelestarian yang sistematis, kekayaan intelektual masa lalu ini terancam hilang tergerus zaman atau rusak karena faktor alam yang tidak bersahabat.
Fokus utama dari institusi ini terletak pada Dayah Syaikhuna yang kini bertransformasi menjadi pusat riset sejarah lokal yang sangat disegani. Dayah, sebagai model pendidikan tradisional, terbukti menjadi penjaga gawang yang tangguh bagi orisinalitas ajaran Islam di nusantara. Di sini, para santri tidak hanya diajarkan untuk menghafal hukum-hukum fikih, tetapi juga didorong untuk memahami konteks sosial di mana ilmu tersebut berkembang. Dengan mempelajari biografi para ulama terdahulu, generasi muda dapat memetik hikmah tentang keteguhan prinsip, adab yang luhur, serta semangat nasionalisme yang berakar pada nilai-nilai ketuhanan yang kuat.
Salah satu program yang paling prestisius di tempat ini adalah proyek Pelestarian Manuskrip kuno yang ditulis tangan oleh para ulama berabad-abad silam. Banyak lembaran kertas yang sudah mulai rapuh dan tintanya memudar ditemukan di berbagai pelosok daerah. Tim dari Dayah Syaikhuna melakukan proses digitalisasi dengan peralatan canggih agar teks-teks tersebut dapat diakses oleh peneliti di seluruh dunia tanpa harus merusak fisik naskah aslinya. Upaya ini sangat krusial karena di dalam manuskrip tersebut terkandung berbagai macam disiplin ilmu, mulai dari astronomi, pengobatan tradisional, hingga strategi diplomasi yang pernah digunakan oleh kesultanan-kesultanan Islam di masa lampau.
Keberadaan Jejak Ulama Nusantara ini adalah bukti fisik bahwa nusantara pernah menjadi pusat peradaban intelektual yang sangat maju. Melalui pembacaan kembali naskah-naskah kuno tersebut, para santri diajak untuk menyadari bahwa Islam di nusantara tidak datang secara instan, melainkan melalui proses dialog budaya yang sangat cerdas dan damai. Pengetahuan yang tersimpan dalam lembaran-lembaran tua ini menjadi modal penting bagi Indonesia untuk membangun karakter bangsa yang berbasis pada kearifan lokal. Dayah Syaikhuna rutin menyelenggarakan pameran dan seminar yang mengupas isi dari tulisan tangan para ulama tersebut agar masyarakat umum juga memiliki rasa bangga terhadap warisan leluhurnya.